Команда учёных Стенфордского университета (США) создала клеточный атлас человеческих лёгких. В докладе не страницах журнала Nature, авторы описали свою работу (включая РНК-последовательность отдельных клеток) и некоторые сведения, открывшиеся в процессе.
При создании атласа исследователи собрали образцы тканей из бронхиол, бронхов и альвеол лёгких, причём вместе с соответствующими им образцами крови. Каждый гистологический образец разбирался на клеточные составляющие, которые сортировались по различным типам: иммунные, эпителиальные, эндотелиальные или стомальные.
Авторы создали транскриптомы для почти 75 000 клеток. С помощью маркеров среди клеток были выявлены 58 клеточных популяций. Затем стало возможным создать профили экспрессии для 91% типов, а также обнаружить 14 ранее неизвестных науке типов лёгочных клеток. Были установлены почти 200 маркеров, с помощью которых идентифицировать открытые типы клеток.
Исследователи установили, что получившийся атлас можно использовать для отслеживания гормональных мишеней в лёгких. Оказалось, что одни гормональные рецепторы широко экспрессированы в разных отделах лёгких, а другие — нет. Учёные смогли определить области с экспрессией 233 генов, что можно использовать для понимания и лечения целого ряда болезней лёгких.
Атлас использовали для сравнения лёгких человека и мышей. Выяснилось, что у мышей отсутствуют примерно 30% клеток из человеческих лёгких, а у человека отсутствуют почти 5% клеток из мышиных лёгких. По мнению авторов доклада, разница указывает, что диверсификация ранних видов млекопитающих была более обширной, чем считалось прежде.
Создатели атласа уверены, что он будет полезен профессионалам самых разных медицинских специальностей.
